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基于线粒体COI基因序列的壮真蝎与普洱真蝎的分子鉴定
基于线粒体COI基因序列的壮真蝎与普洱真蝎的分子鉴定
作者:
李春青
李蓉
杨振升
肖蘅
郑雨田
陈善元
陈艳艳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
壮真蝎
普洱真蝎
COI基因
分子鉴定
摘要:
对蝎类物种的传统分类主要依靠形态和行为特征,但由于该类群种间形态特征极为相似,物种的划分和鉴定困难.为弥补传统分类方法的不足,本研究以线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ (COI)基因作为分子标记,对形态相似的壮真蝎Euscorpiops validus和普洱真蝎E.puerensis进行分子水平的物种鉴定.采用PCR扩增测序获得壮真蝎与普洱真蝎共24个样本的COI基因部分片段序列(660 bp),进行了遗传距离、系统发育及单倍型网络图分析.结果显示:壮真蝎15个样本中共检测到4个单倍型,单倍型之间的相似度为99.3% ~99.8%;普洱真蝎9个样本中共检测到4个单倍型,单倍型之间的相似度为99.6% ~99.8%;2种蝎的种间序列相似度为90.1%~90.6%,单倍型间的稳定差异核苷酸位点数为61个.壮真蝎与普洱真蝎种内平均遗传距离分别为0.0040、0.002 3,种间平均遗传距离为0.103 9,且种间遗传距离为种内的34.6倍.此外,分子系统发育树显示壮真蝎与普洱真蝎的单倍型序列各自聚为2个单系枝,且具有很高的分枝自举值(100%).单倍型网络图结果也显示壮真蝎与普洱真蝎8个单倍型明显分为2大类群,且壮真蝎的单倍型HAP2与普洱真蝎的单倍型HAP7之间的突变步数高达62步.上述结果不仅进一步确认壮真蝎与普洱真蝎为2个不同的物种,且表明线粒体COI基因可用于开展真蝎属Euscorpiops物种的分子鉴定.
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文献信息
篇名
基于线粒体COI基因序列的壮真蝎与普洱真蝎的分子鉴定
来源期刊
四川动物
学科
生物学
关键词
壮真蝎
普洱真蝎
COI基因
分子鉴定
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
139-144
页数
6页
分类号
Q953|Q38
字数
4472字
语种
中文
DOI
10.11984/j.issn.1000-7083.20160305
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
肖蘅
云南大学生命科学学院
26
211
7.0
13.0
2
李蓉
云南大学生命科学学院
9
12
3.0
3.0
3
陈善元
云南大学生命科学学院
13
96
4.0
9.0
4
李春青
云南大学生命科学学院
11
18
3.0
3.0
5
陈艳艳
云南大学生命科学学院
5
8
2.0
2.0
6
郑雨田
云南大学生命科学学院
1
1
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杨振升
云南大学生命科学学院
1
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传播情况
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引文网络
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二级引证文献(0)
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二级引证文献(0)
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节点文献
壮真蝎
普洱真蝎
COI基因
分子鉴定
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
四川动物
主办单位:
四川省动物学会
四川省野生动植物保护协会
四川大学
成都大熊猫繁育研究基金会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7083
CN:
51-1193/Q
开本:
大16开
出版地:
成都市望江路29号四川大学生命科学学院内
邮发代号:
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
4190
总下载数(次)
12
总被引数(次)
21965
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