苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选

• 作者: 兰进好 刘春晓 刘源霞 孙晓红 张玉刚 戴洪义 柏素花
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 高分辨率熔解曲线 炭疽菌叶枯病 SNP标记 InDel标记 精细定位
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 215-222
• 页数: 8页
• 分类号: S661.1
• 字数: 4915字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0519

摘要

以207株‘金冠’与‘富士’苹果的F1杂交分离群体实生树为试材,挑选抗炭疽菌叶枯病基因Rgls位点区域内的,第15条染色体上,位于SSR标记S0304673和S0405127之间500kb物理距离内,由全基因组重测序技术所获得的与抗该病相关的10个SNP及10个InDel标记,通过高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting,HRM)技术筛选出与基因Rgls位点紧密连锁的2个SNP及4个InDei标记.通过对重组个体的基因型及表型分析,发现标记InDel4227和InDe14254表现出与Rgls基因位点共分离,将基因Rgls精细定位于标记InDel4199和SNP4299之间100kb的物理距离内.对该基因位点两侧4.1～4.3Mb距离内的基因进行统计分析,表明在该区段内存在40个有功能注释的基因,涉及到细胞组成、分子功能和生物过程方面共19个GO分类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张玉刚	青岛农业大学园艺学院青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室	55	384	11.0	17.0
2	孙晓红	青岛农业大学生命科学学院	17	67	4.0	8.0
3	柏素花	青岛农业大学生命科学学院	26	126	7.0	11.0
4	刘源霞	青岛农业大学园艺学院青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室	14	78	5.0	8.0
5	兰进好	青岛农业大学农学与植物保护学院	21	145	8.0	11.0
6	刘春晓	青岛农业大学园艺学院青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室	2	13	1.0	2.0