天祝白牦牛OXGR1基因多态性与体尺性状的关联性分析

• 作者: 张全伟 张勇 王琪 赵兴绪 马友记
• 来源期刊: 兽类学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 牦牛 OXGR1基因 多态性 HRM 体尺性状
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 379-388
• 页数: 10页
• 分类号: Q953.3
• 字数: 5190字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16829/j.slxb.201704008

摘要

为了研究牦牛α-酮戊二酸(盐)受体1(Oxoglutarate receptor 1,OXGR1)基因多态性与其体尺性状的相关性,本文以4-8岁天祝雄性(阉)白牦牛的血液DNA (n=192)为实验材料并构建DNA混合池.通过DNA直接测序法检测OXGR1的核苷酸序列潜在的多态位点;利用高分辨率熔解曲线分析技术(High Resolution Melting,HRM)进行分型.采用SHESIS软件对OXGR1基因多态位点进行连锁不平衡分析;运用PIC-Calc 0.6软件分析多态信息含量;采用卡方检验检测Hardy-Weinberg平衡;运用SPSS20.0软件对多态位点与体尺性状进行关联分析;运用RNAFOLD、ExPASy和Swiss-model软件对OXGR1基因突变前后的蛋白结构进行预测分析.结果表明:天祝白牦牛OXGR1基因有两个多态位点,分别为347 (A/G)和678 (G/A),每个位点均有3种基因型(AA、AG和GG),其优势基因型分别为GG和AA.两个SNPs均达到Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05),存在强连锁不平衡(D'＞0.75,R2 ＞0.33),且均表现为中度多态(0.25 ＜PIC ＜0.5).上述位点不同基因型在体斜长、体高、胸围和管围存在显著差异(P＜0.05).分子结构预测显示:347位点处突变为错义突变,其编码的氨基酸由天冬酰胺变为丝氨酸.突变后OXGR1 mRNA二级结构、蛋白质二级结构及三级结构均发生改变.上述结果表明:OXGR1基因可作为牦牛分子育种的候选分子标记,为今后牦牛遗传资源的保护、开发以及新品种的选育提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵兴绪	甘肃农业大学动物医学院	178	766	13.0	19.0
5	张勇	甘肃农业大学动物医学院	147	410	9.0	11.0
9	马友记	甘肃农业大学动物科技学院	83	410	11.0	17.0
10	王琪	甘肃农业大学动物医学院	12	24	3.0	4.0
11	张全伟	甘肃农业大学生命科学技术学院	26	49	4.0	6.0