长链非编码RNA1010001N08Rik在支气管肺发育不良形成中的表达规律及生物信息学分析

• 作者: 包天平 张媛 杨丽娟 王会芳 王秀桂 田兆方 程怀平 赵赛
• 来源期刊: 中华新生儿科杂志（中英文）
• 关键词: 支气管肺发育不良 RNA 分子生物学 小鼠 1010001N08Rik
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 384-388
• 页数: 5页
• 字数: 4028字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.2096-2932.2017.05.015

摘要

目的 初步研究长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA) 1010001N08Rik在高氧诱导新生小鼠支气管肺发育不良(bronchopulmonarydysplasia,BPD)形成过程中的表达规律,并对其进行系统的生物信息学分析,预测其参与BPD发生发展的可能作用机制.方法 通过UCSC在线基因浏览工具获取1010001N08 Rik序列、所在基因组位置及其邻近基因相关信息;应用Ensemble数据库预测1010001N08Rik的靶基因.将新生C57BL/6J小鼠置于95％高氧环境下7d,制备高氧诱导新生小鼠BPD模型.采用逆转录聚合酶链反应检测1010001N08Rik、Gata 6 mRNA在BPD形成过程(第0、1、3、5、7天)中的变化情况,并通过t检验比较其表达差异.结果 1010001N08Rik在BPD形成过程第1、3、5、7天相对表达量分别为1.21±0.33、2.02±0.41、2.95±0.45、4.20±0.48,其表达逐渐增加,且第1、3、5、7天各组相近两个时点间差异均有统计学意义(P＜ 0.05);Gata 6 mRNA第1、3、5、7天相对表达量分别为0.92±0.30、1.10±0.31、0.86±0.24、0.45±0.08,第7天低于第5天(P＜0.05),其余相近两个时间点比较差异无统计学意义(P＞0.05).1010001N08Rik在哺乳动物间具有较高的保守性,其所在染色体区域存在大量转录因子结合位点及表观遗传学线索,Gata 6为其可能的调控靶标.结论 1010001N08Rik在BPD形成过程中表达量逐渐增加,生物信息学分析及初步实验提示其可能通过下调Gata 6表达参与BPD形成过程.