基于致病基因序列的LAMP方法检测番茄种子携带的溃疡病菌

• 作者: 吕青阳 李健强 罗来鑫 蒋娜 韩思宁
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄溃疡病菌 环介导等温扩增 种子提取液 快速检测
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 630-639
• 页数: 10页
• 分类号: S432.42
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000028

摘要

本研究选取番茄溃疡病菌(Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis,Cmm)致病岛上的chpC基因的部分序列,作为环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)靶标片段进行LAMP引物设计.对反应体系优化后进行特异性测定,结果表明供试的89株番茄溃疡病菌中86株检测结果为阳性,3株为阴性,供试的14株非番茄溃疡病菌(其他重要植物病原细菌)均为阴性.检测番茄溃疡病菌菌悬液样品的阈值为4.8×105 CFU·mL-1,对DNA样品的检测阈值为1.8×10-2 ng·μL-1,并据此建立了番茄溃疡病菌的LAMP检测方法.将该方法应用于番茄种子携带Cmm的检测,通过提取种子浸提液样品的总DNA,实现了对番茄种子携带Cmm的直接检测.与普通PCR相比,该方法更加快捷简便,不依赖PCR仪等昂贵的仪器设备,可以丰富现有的番茄溃疡病菌分子检测体系,为口岸等检疫部门提供简单易行的检测初筛手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李健强		118	1716	24.0	33.0
2	罗来鑫		15	100	4.0	10.0
3	吕青阳		1	0	0.0	0.0
4	蒋娜		2	1	1.0	1.0
5	韩思宁		1	0	0.0	0.0