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利用数字基因表达谱探究大猿叶虫响应光周期滞育诱导的机制
利用数字基因表达谱探究大猿叶虫响应光周期滞育诱导的机制
作者:
刘文
孙丹
尹涵
朱莉
王小平
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大猿叶虫
生殖滞育
光周期
滞育诱导
转录组
摘要:
滞育是昆虫提前感受不利环境信号的暗示,进而调节自身进入一种生长、发育停滞的生理生态过程。光周期作为最稳定的环境信号,是诱导昆虫触发滞育程序最重要的环境信号。然而,昆虫如何感受光周期变化而被诱导进入滞育对于生物学家而言仍是一个谜。因此,本研究以大猿叶虫Colaphellus bowringi Baly为对象,深入探究昆虫对光周期滞育诱导的分子应答机制。大猿叶虫是一种兼性滞育昆虫,在长日照条件下可被诱导进入生殖滞育,幼虫期是光周期诱导其进入滞育的关键阶段。本研究对滞育诱导(25℃,LD 16:8)和非滞育诱导(25℃,LD 12:12)条件下获得的大猿叶虫3、5、7日龄幼虫头部进行转录组测序并建立了数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGEs)。研究结果表明,测序共得到平均长度为1 468 bp的78 899条Unigene序列信息,分别有43 525条(55.2%)、30 844条(39.1%)、13 011条(16.5%)转录本在NCBI、KEGG、GO数据库中获取注释信息。分析滞育诱导和非滞育诱导条件下相同日龄幼虫头部DGEs结果发现,3、5、7日龄的差异基因数目分别为19、116、98个,相较于非滞育诱导条件下的个体而言,滞育诱导条件下的3、5、7日龄个体中上调基因数目分别为8(42.1%)、114(98.3%)、97(99.0%)个,下调基因数目分别为11(57.9%)、2(1.7%)、1(1%)个,并且随着幼虫日龄增加,上调表达的基因数目及占差异基因的比例呈持续上升趋势。进一步分析KEGG结果发现,多个与细胞通讯及信号传导相关的通路在滞育诱导个体中显著富集,如Calcium signaling、ECM-receptor interaction、Tight junction、Focal adhesion、Regulation of actin cytoskeleton等信号通路,且相关基因均上调表达。在昆虫中,前两者与环境信号处理相关,后三者则参与了信息传递、细胞运动及物质运输等多种生命活动。这些细胞通讯及信号传导相关通路的基因在光周期滞育诱导中显著上
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大猿叶虫
滞育
滞育诱导
光周期
夏滞育
定量反应
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
利用数字基因表达谱探究大猿叶虫响应光周期滞育诱导的机制
来源期刊
华中昆虫研究
学科
生物学
关键词
大猿叶虫
生殖滞育
光周期
滞育诱导
转录组
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
248-248
页数
1页
分类号
Q965
字数
语种
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王小平
华中农业大学植物科学技术学院
56
359
12.0
17.0
2
朱莉
华中农业大学植物科学技术学院
7
12
2.0
3.0
3
孙丹
华中农业大学植物科学技术学院
2
20
1.0
2.0
4
刘文
华中农业大学植物科学技术学院
17
144
5.0
12.0
5
尹涵
华中农业大学植物科学技术学院
5
5
2.0
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传播情况
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(0)
二级引证文献
(0)
2017(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
大猿叶虫
生殖滞育
光周期
滞育诱导
转录组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华中昆虫研究
主办单位:
河南省昆虫学会
出版周期:
不定期
ISSN:
CN:
开本:
16开
出版地:
河南省郑州市
邮发代号:
创刊时间:
2002
语种:
chi
出版文献量(篇)
607
总下载数(次)
6
总被引数(次)
312
期刊文献
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