基于显性模型的基因组选择中贝叶斯方法研究

• 作者: 朱波 李俊雅 王延晖
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 全基因组选择 贝叶斯模型 显性效应 显性系数
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 60-67
• 页数: 8页
• 分类号: S813.1
• 字数: 6366字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.01.007

摘要

本研究旨在探索显性效应对基因组育种值估计准确性的影响.基于贝叶斯A模型,根据加性效应和显性效应相关性,提出两种子模型:1)加性效应和显性效应相互独立的BayesAD1模型;2)显性系数(Dominant coefficients)与加性效应的绝对值相互独立,并且显性系数服从正态分布的BayesAD2模型.通过模拟数据比较加性效应模型BayesAD0和两种显性效应模型下基因组估计育种值(GEBV)的准确性,并且研究不同数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)数、全同胞家系内个体数和加性方差与显性方差的比重对GEBV准确性的影响.结果表明,显性模型可以减缓随着世代变化GEBV的准确性降低的趋势.另外,显性方差的比重越大,对GEBV的准确性影响越大.当加性方差与显性方差之比达到0.25时,BayesAD2有较大优势,分别比BayesAD1和BayesAD0准确性高20.3％和28.4％.全同胞数越多,GEBV的准确性越高,QTL数目增多,GEBV估计的准确性随之下降.结果显示,对显性效应占较大比重即低遗传力的性状进行育种值估计时,考虑显性效应可以提高育种值估计准确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李俊雅	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	62	320	10.0	14.0
2	朱波	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	10	224	6.0	10.0
3	王延晖	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	1	4	1.0	1.0