基于线性神经网络和多参数的蛋白质相似度算法

• 作者: 刘莹 师会谭 张建华 张琳婧
• 来源期刊: 郑州大学学报（理学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质 相似度 多参数 算法模型 线性神经网络
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 103-107
• 页数: 5页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 3243字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13705/j.issn.1671-6841.2016230

摘要

提出一种新的蛋白质结构相似度算法,目的在于通过比对蛋白质的结构寻找功能上的相似性.收集约1 000对蛋白质的PDB结构文件,采用RCSB PDB结构比对工具获取每一对蛋白的结构匹配相似度,并计算每一对蛋白质的9个参数的相似度.采用线性神经网络建立总体相似度和9个参数之间的数学模型.计算模型的仿真误差,并选取若干蛋白质对该算法模型进行应用验证.所建立模型仿真误差为8.76%,验证结果与已有工具结果基本相同,但个别有一定差异.该算法可用于比较蛋白质的结构相似度,且比对结果可以对蛋白质功能的相似性进行提示.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张建华	郑州大学电气工程学院	87	604	15.0	20.0
5	刘莹	郑州大学电气工程学院	70	267	8.0	14.0
6	师会谭	郑州大学电气工程学院	1	0	0.0	0.0
7	张琳婧	郑州大学电气工程学院	2	0	0.0	0.0