烟台黑猪SLA-DRA基因编码区多态性及生物信息学分析

• 作者: 杨巧丽 滚双宝 袁军虎 马艳萍 黄晓宇
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: SLA-DRA基因 烟台黑猪 编码区 多态性 蛋白质结构 分子进化树
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 86-93
• 页数: 8页
• 分类号: S828|Q78
• 字数: 6305字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.01.014

摘要

为了探究烟台黑猪SLA-DRA基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对SLA-DRA基因4个外显子的多态性、蛋白质的理化性质、结构域、蛋白质的空间结构和功能进行了预测和分析.结果显示:SLA-DRA基因exon 1、exon 2和exon 4共检测到11个SNPs,导致7个氨基酸发生变异,exon 3没有突变产生,exon 4的多态性最丰富.SLA-DRA基因编码区759 bp核苷酸共编码252个氨基酸和1个终止子.SLA-DRA基因蛋白质是一种偏酸性、不稳定、亲水性蛋白质,其二级结构是混合型,其中无规则卷曲最多.该蛋白质含有2个免疫球蛋白结合域、2个N-糖基化位点和10个磷酸化位点.功能分析显示:SLA-DRA基因蛋白质在信号转导、受体、胁迫应答、免疫应答、生长因子等方面的几率均较高.研究结果可为猪的抗病分子育种候选基因筛选提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	滚双宝	甘肃农业大学动物科学技术学院	82	391	12.0	15.0
5	马艳萍	甘肃农业大学动物科学技术学院	8	26	3.0	5.0
6	黄晓宇	甘肃农业大学动物科学技术学院	5	2	1.0	1.0
7	杨巧丽	甘肃农业大学动物科学技术学院	15	74	5.0	8.0
8	袁军虎		2	2	1.0	1.0