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扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析
扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析
作者:
张帅
张志伟
柳小龙
田浩楷
赵莉蔺
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
松材线虫
扩散型虫态
数字基因表达谱
差异表达基因
摘要:
[目的]松材线虫作为林业重大外来入侵种,扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用,但扩散虫态的形成与维持机制尚未阐明.[方法]通过构建松材线虫数字基因表达谱(DGE),从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异.[结果]参考松材线虫基因组数据,鉴定出2种扩散型幼虫(LⅢ,LⅣv)和繁殖型幼虫(Ln)各有11184、8533和10781个基因.相对于繁殖型虫态,大多数基因在LⅣ中下调表达,该虫态中特异上调表达的基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因.推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关,并在其生理功能如化学感受和媒介/寄主互作中发挥作用.GO和Pathway富集分析显示,多数代谢相关通路在LⅣ中下调表达,而在LⅢ中的表达均活跃.[结论]以上结果与LⅣ处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致.
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篇名
扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析
来源期刊
生物安全学报
学科
关键词
松材线虫
扩散型虫态
数字基因表达谱
差异表达基因
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
111-121
页数
11页
分类号
字数
8945字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-1787.2017.02.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
赵莉蔺
中国科学院动物研究所农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室
25
402
12.0
20.0
2
张帅
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
40
249
9.0
13.0
3
张志伟
山西农业大学林学院
13
15
2.0
3.0
4
田浩楷
山西农业大学林学院
2
8
2.0
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柳小龙
山西农业大学林学院
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节点文献
松材线虫
扩散型虫态
数字基因表达谱
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物安全学报
主办单位:
中国植物保护学会
福建省昆虫学会
出版周期:
季刊
ISSN:
2095-1787
CN:
35-1307/Q
开本:
16开
出版地:
福建省福州市金山福建农林大学
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
584
总下载数(次)
2
总被引数(次)
2403
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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