小黑杨HD-Zip转录因子家族生物信息学及应答盐胁迫分析

• 作者: 周博如 姚文静 姜廷波 张雪梅 赵凯
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: HD-Zip转录因子 非生物胁迫 生长发育 小黑杨 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 715-721
• 页数: 7页
• 分类号: S722.3+6
• 字数: 4651字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2017.05.011

摘要

HD-Zip转录因子基因是植物中特有的一类蛋白家族,在植物生长发育和逆境应答胁迫过程中发挥重要作用.HD-Zip转录因子基因是由高度保守的同源异型结构域(HD)和亮氨酸拉链域(LZ)结构域构成的特殊结构模型.杨树HD-Zip转录因子家族共有63个基因,可被分为HD-Zip I、HD-ZipⅡ、HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ四个亚家族.本文利用RNA-Seq分析了盐胁迫条件下HD-Zip基因家族在小黑杨根、茎、叶等不同组织的基因表达差异,从转录组水平揭示其应答胁迫环境的分子机制,结果表明,盐胁迫下在叶中有25个HD-Zip基因下调表达,21个基因上调表达;茎中有42个基因下调表达,11个基因上调表达;根中有26个基因下调表达,24个基因上调表达.另外,本文根据拟南芥HD-Zip转录因子家族基因的已知功能,预测了杨树HD-Zip转录因子同源基因的功能,并利用生物信息学方法分析了杨树HD-Zip转录因子蛋白序列的保守结构域、氨基酸组成和理化性质等,为进一步研究杨树HD-Zip转录因子基因功能提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周博如	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	14	78	5.0	8.0
2	赵凯	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	7	53	3.0	7.0
3	姜廷波	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	22	130	7.0	11.0
4	张雪梅	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	5	12	2.0	3.0
5	姚文静	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	1	3	1.0	1.0