秋茄(Kandelia candel L.)响应重金属胁迫的数字基因表达谱

• 作者: 余如凤 傅梦妮 刘锴栋 袁柳娇 袁长春 陈燕 黎海利
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 秋茄 重金属 污水胁迫处理 数字基因表达谱(DEG) 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 页码范围: 22-28
• 页数: 7页
• 分类号: S718.4
• 语种: 中文

摘要

基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对重金属污水胁迫处理组和对照组秋茄材料进行转录组测序分析.结果表明,重金属污水胁迫处理样品与对照样品相比,共筛选出的3097个差异表达基因,其中2202个表达上调,895个表达下调.GO功能显著性富集分析出38个GO分类条目,大量与生长发育,代谢调控,环境刺激响应相关的基因表现为富集.进一步的KEGG代谢途径分析表明,差异表达基因主要与糖类、核酸、蛋白质和脂质等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程有关.转录因子分析发现bHLH,MYB,NAC和WRKY在重金属胁迫中发挥重要作用.此外,重金属胁迫还促进萜类、黄酮类化合物生物合成的关键酶基因(牻牛儿基焦磷酸合酶(Unigene0029352)、黄酮醇合成酶(Unigene0010384))的表达,进而促进秋茄有效成分的积累;显著诱导细胞分裂素相关基因type-b响应调节子ARR2(Unigene0033740)的表达、抑制油菜素内酯的信号转导组分基因BSK(Unigene0008986)的表达,进而提高秋茄对重金属胁迫的适应能力.实验选取了5个与环境刺激响应密切相关的基因,通过qRT-PCR验证了它们在重金属污水胁迫处理下的表达差异,结果与数字基因表达谱分析的结果较为一致,证实了差异表达基因数据的有效性.说明在重金属胁迫处理下,秋茄通过调节基因表达提高自身对污染胁迫的耐受能力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁长春		31	78	5.0	6.0
2	袁柳娇		5	10	2.0	3.0
3	余如凤		5	10	2.0	3.0
4	刘锴栋		41	82	5.0	5.0
5	陈燕		23	41	4.0	5.0
6	黎海利		27	65	5.0	5.0
7	傅梦妮		1	5	1.0	1.0