柱型苹果MdCoLBD1/2基因生物信息学及SNP分析

• 作者: 侯鸿敏 刘政礼 周亚平 姜仁珍 张玉刚 戴洪义 祝军
• 来源期刊: 青岛农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 柱型苹果 LOB结构域 MdCoLBD1/2基因 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 果树种质资源与育种
• 页码范围: 100-106
• 页数: 7页
• 分类号: S661.1
• 字数: 2622字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1674-148X.2017.02.005

摘要

柱型苹果(Columnar apple)是苹果株型育种的珍贵资源.利用同源基因克隆方法,以柱型苹果"威塞克旭"一年生枝上休眠期芽cDNA为模板,克隆得到了LOB DOMAIN家族(LBD)的2个同源基因,命名为MdCoLBD1/2,分别编码195和240个氨基酸.该基因有LBD家族的典型结构域,如C盒、GAS盒、亮氨酸拉链(Leu zipper)结构以及LOB Domain区域等.MdCoLBD1/2分别定位于第10条染色体Chr10:18985568..19005801和MdCoLBD2 Chr10:18985594..19005850区间.MdCoLBD1/2与白梨、葡萄、草莓、椰子、梅、核桃的氨基酸的相似性均在60%以上.聚类分析表明MdCoLBD1和白梨、梅、草莓亲缘关系较近,MdCoLBD2与葡萄、核桃亲缘关系较近,MdCoLBD1/2与亚洲棉、陆地棉的聚类关系均较远.通过测序分析了MdCoLBD1/2基因在30个不同类型材料中的碱基序列差异,得到MdCoLBD1有8个碱基差异位点,MdCoLBD2有5个碱基差异位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张玉刚	青岛农业大学园艺学院	55	384	11.0	17.0
3	戴洪义	青岛农业大学园艺学院	88	585	13.0	20.0
6	祝军	青岛农业大学园艺学院	34	170	8.0	11.0
7	侯鸿敏	青岛农业大学园艺学院	9	12	2.0	3.0
8	周亚平	青岛农业大学园艺学院	7	45	2.0	6.0
9	姜仁珍	青岛农业大学园艺学院	3	9	1.0	3.0