干旱胁迫下枇杷叶片的转录组分析

• 作者: 王丹 龚荣高
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枇杷 干旱胁迫 转录组 差异表达
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 60-67
• 页数: 8页
• 分类号: Q78|S667.3
• 字数: 5906字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.01.010

摘要

分析干旱胁迫下枇杷叶片的转录组,挖掘功能基因并对其差异表达基因进行筛选和分析,为枇杷抗旱提供理论依据.利用新一代高通量测序技术测序,对测序结果进行de novo拼接、功能注释和ORF预测,将差异表达基因在COG、GO和KEGG数据库中进行比对注释.测序结果表明,获得转录本共88 530个,平均长度为740.64 bp,ORF41 748条.COG、GO和KEGG数据库将转录本分别划分为24,54个功能类别及291条代谢通路中.25 197个差异表达的基因在30条代谢通路中显著富集,与酶活性、激素合成代谢和信号转导等相关的差异基因积极响应枇杷干旱,其中双萜类、油菜素类固醇和类胡萝卜素3条生物合成途径中的差异基因呈现出较为一致的表达.采用实时荧光定量(qRT-RCR)对选取的差异基因进行验证,其中过氧化物酶、蛋白激酶byr2、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶、脱落酸8'-羟化酶、吲哚-3-乙酰乙酸合酶相关基因上调表达,细胞色素P450 734A1基因下调表达.为枇杷提供了较为全面的基因信息和代谢途径数据,为干旱胁迫下枇杷分子调控机制的深入研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚荣高	四川农业大学园艺学院	31	510	12.0	21.0
2	王丹	四川农业大学园艺学院	13	100	7.0	10.0