应用PCR-DGGE和Q-PCR分析不同体重斑点叉尾(鮰)皮肤、鳃和胃肠道菌群结构

• 作者: 倪学勤 刘倩 孙豪 时云朵 曾东
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 斑点叉尾(鮰) PCR-DGGE Q-PCR 皮肤菌群 鳃菌群 肠道菌群
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 156-164
• 页数: 9页
• 分类号: S941
• 字数: 5251字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2017.15480

摘要

采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量-聚合酶链式反应(Q-PCR)技术分析高体重(high weight,HW)和低体重(low weight,LW)斑点叉尾(鮰)(Ietalurus punetaus)皮肤、鳃和胃肠道菌群多样性,为斑点叉尾(鮰)微生态研究及筛选斑点叉尾(鮰)源益生菌提供理论依据.结果显示,斑点叉尾(鮰)菌群丰富度由低到高依次为鳃、皮肤、前肠、后肠和胃.肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和气单胞菌属(Aeromonas)是皮肤的优势菌群;肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、气单胞菌属(Aeromonas)和肠球菌属(Enterococeus)是水体、鳃和胃的优势菌群;肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、拟杆菌属(Bacteroidetes)、气单胞菌属Aeromonas)和酵母菌属(Saccharomyces)是肠道的优势菌群.HW斑点叉尾(鮰)鳃菌群的香农多样性指数、均匀度和丰富度及前肠菌群的丰富度显著高于LW斑点叉尾(鮰)(P＜0.05).皮肤的黄杆菌属(Flavobacterium),胃的肠杆菌科(Enterobacteriaceae),前肠的拟杆菌属(Bacteroidetes)和双歧杆菌属(Bfidobacterium及后肠的拟杆菌属(Bacteroidetes)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)和酵母菌属(Saccharo-myces)的拷贝数分别是101 97、107.69、106.19、103.83、106.13、103.92和104 26,均显著高于LW斑点叉尾(鮰)(P＜0.05).结果表明,斑点叉尾(鮰)皮肤、鳃、胃肠道均形成独特的菌群结构,LW和HW斑点叉尾(鮰)菌群结构存在明显差异,HW斑点叉尾(鮰)菌群多样性增加.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪学勤	四川农业大学动物医学院	103	967	18.0	27.0
2	曾东	四川农业大学动物医学院	55	321	11.0	16.0
3	时云朵		11	20	3.0	4.0
4	孙豪	四川农业大学动物医学院	9	17	3.0	4.0
8	刘倩	四川农业大学动物医学院	6	35	2.0	5.0