一起急性腹泻疫情中检出的GI.8型诺如病毒的序列测定和分子特征分析

• 作者: 吴晓芳 纪蕾 陈莉萍 韩建康
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 诺如病毒 GI.8 全基因组
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 613-616,623
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 字数: 2668字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2017.07.008

摘要

目的 对湖州地区一起急性腹泻疫情中检出的GI.8型诺如病毒进行序列测定和分子特征分析.方法 根据GI型诺如病毒保守序列自行设计5对引物,用一步法RT-PCR分段扩增GI.8型诺如病毒CHN/Huzhou/N10的全基因组序列,采用生物信息学相关软件对序列进行整理和分析.结果 CHN/Huzhou/N10全长7 740 bp,编码区包括3个开放读码框架(ORF1～ORF3),分别长5 400 bp(5～5 404 nt)、1 632 bp(5 388～7 019 nt)和642 bp(7 019～7 660 nt).RdRp区,VP1区和VP2区的系统进化分析显示CHN/Huzhou/N10属于GI.8基因型.衣壳蛋白区的氨基酸序列分析表明,与原型株Boxer/2001/US相比,CHN/Huzhou/N10 VP1区的氨基酸序列共有16个变异位点,12个位于P2区.其中aa347T→S,aa397T→E这2个变异位点分别位于HBGA受体结合袋位点Ⅱ和Ⅲ内.结论 本文获得了我国GI.8型诺如病毒CHN/Huzhou/N10的全基因组序列,相关序列信息可用于病毒的遗传进化研究、快速诊断试剂的研发以及疫苗的设计.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	纪蕾		1	2	1.0	1.0
2	吴晓芳		1	2	1.0	1.0
3	陈莉萍		1	2	1.0	1.0
4	韩建康		1	2	1.0	1.0