C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列预测方法的研究进展

• 作者: 杨冬 沈磐 贺福初
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: 转录因子 C2H2型锌指蛋白 靶序列预测
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 综述与专论
• 页码范围: 573-579
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2017.0047

摘要

C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列仍不明确,这阻碍了C2H2型锌指蛋白的功能研究.目前,针对C2H2型锌指蛋白的靶序列预测已有一些初步的研究.本文介绍了C2H2型锌指基序与DNA结合的经典模式,并对C2H2型锌指蛋白靶序列预测方法中所用到的算法、训练集、金标准数据集及相应工具进行了全面系统的总结归纳,旨在丰富对C2H2型锌指蛋白靶序列预测原理和工具的认识,为C2H2型锌指蛋白靶序列的精确预测和更深入的功能研究打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺福初		23	0	0.0	0.0
2	杨冬		5	442	1.0	5.0
3	沈磐		1	0	0.0	0.0