牦牛体外成熟卵母细胞差异转录组学研究

• 作者: 兰道亮 李键 泽让东科 熊显荣 艾鹥 陈亚冰
• 来源期刊: 中国科学（生命科学）
• 关键词: 牦牛 卵母细胞 GV期 M Ⅱ期 体外成熟 RNA-Seq 转录组 分子机制
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1099-1112
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/N052017-00017

摘要

卵母细胞体外成熟环节是现代繁殖育种技术的基础环节,体外成熟的M Ⅱ期卵母细胞的质量直接影响了卵母细胞的后续受精及受精卵卵裂.由于卵母细胞的发育成熟是一个涉及大量基因转录调控的复杂过程.因此,转录组学研究是了解卵母细胞发生发育的关键.本研究以高海拔地区的特有牛属动物牦牛(Bos grunniens)卵母细胞作为研究对象,应用RNA-seq技术对牦牛GV期卵母细胞及体外成熟M Ⅱ期卵母进行转录组学测序及比对分析.经深度测序后,各获得一个包含51380686条过滤测序序列(clean reads),4624261740碱基(bp)的GV期牦牛卵母细胞测序文库和一个包含50303412条过滤测序序列(cleanreads),4527307080碱基(bp)的M Ⅱ期牦牛卵母细胞测序文库.基因覆盖率统计表明,GV期和M Ⅱ期文库中分别有16719条和16339条牦牛基因得到转录.通过比较分析M Ⅱ和GV期转录组数据,共筛选出4767个差异表达基因,其中1418个基因表达量上调和3349个基因表达量下调.GO功能分类注释显示,差异基因与“代谢过程”等生物学过程存在密切关联,同时结合分子功能相关类别等分子事件表现活跃.按表达量上调和下调分别对差异基因进行KEGG通路互作分析,结果表明,凋亡通路、内吞通路及代谢通路是上调的关键调控通路,而代谢通路、丙酮酸代谢、黏着斑及氧化磷酸化是下调的关键调控通路,其中代谢通路在上调及下调通路互作中均起关键调控作用.进一步对代谢通路进行分析,结果表明,组氨酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、乙醛酸和二羧酸代谢及谷胱甘肽代谢是整个代谢通路的关键调控节点.此外,本研究发现,在牦牛卵母细胞体外成熟过程中,与免疫相关的白细胞介素家族及干扰素家族基因发生了显著差异表达.该研究结果为进一步解析牦牛卵母细胞发育的分子机制及全面了解牦牛繁殖的特异性提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李键		117	464	10.0	15.0
2	泽让东科		18	65	4.0	7.0
3	艾鹥		9	31	3.0	5.0
4	兰道亮		46	196	7.0	10.0
5	陈亚冰		22	91	6.0	8.0
6	熊显荣		39	109	6.0	7.0