版纳微型猪近交系RNF4基因克隆、多组织qPCR表达及功能生物信息学分析

• 作者: 张霞 曾日彬 王淑燕 王配 陈园园 霍金龙
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: RING指环 版纳微型猪近交系 组织表达 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 24-30
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 3749字
• 语种: 中文

摘要

RNF4基因调节精细胞分化和增殖过程,文章以GenBank下载的猪及近缘物种RNF.mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(BMI)RNF4基因.应用qPCR分析15个重要组织mRNA表达谱,并对蛋白质序列作功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树.研究获得BMIRNF4 573 bp编码区序列(GenBank登录号:KU705638,对应氨基酸登录号:AOC89056),编码190个氨基酸,蛋白质分子质量(Mw)为21.43 ku,等电点(pI)为6.95.多组织荧光定量表达分析表明RNF4基因在尿道球腺、睾丸、肝、肺中高水平表达;在其他11个组织中呈中低水平表达.功能生物信息学分析表明RNF4蛋白质存在1个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4类功能活性位点,位于细胞核概率为94.1％.系统进化分析表明,BMI与狗亲缘关系最近.结果为研究RNF4基因在猪精细胞分化和增殖方面作用奠定基础.