水滴伪康纤虫全长cDNA文库的构建及EST分析

• 作者: 曾红 林能锋
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水滴伪康纤虫 cDNA文库 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 921-925
• 页数: 5页
• 分类号: Q959
• 字数: 3092字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.09.001

摘要

水滴伪康纤虫为海水养殖鱼类的重要危害性寄生虫.采用SMART技术构建营养期水滴伪康纤虫全长cDNA文库,初始文库滴度3.3×106 pfu·mL-1,文库容量约为1.5×107 pfu,重组率97％.随机挑取24个克隆,经PCR检测插入的片段长度在0.3～2.0 kb,平均长度＞500 bp.挑选文库中的1 200个克隆进行表达序列标签测序,得到1 032条高质量的EST,与NCB2数据库进行比对后,获得292个同源基因,其中包含190条单拷贝EST和102个重叠群,冗余度为71.7％.有215条EST在Tetrah ymena thermophila,Paramecium tetraurelia,Ichth yophthirius multifiliis,Cryptocaryon irritans,Ox ytricha trifallax等自由生活及寄生种类的纤毛虫的基因组中比对到同源基因,其中有134条EST具有功能注释,其余为未知功能的假定蛋白基因.水滴伪康纤虫cDNA文库的构建及EST测序的完成,为进一步发现和研究水滴伪康纤虫的功能基因奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾红	福建师范大学生命科学学院	23	168	6.0	12.0
2	林能锋	福建省农业科学院生物技术研究所	24	377	10.0	19.0