珠子参β-香树素合成酶基因的克隆和生物信息学分析

• 作者: 吴亚运 张绍鹏 赵小龙 陈平
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 珠子参 β-香树素合成酶 三萜皂苷 基因克隆 生物系信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 109-117
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.02.016

摘要

β-香树素合成酶(beta-amyrin synthaseβAS)是定向分流齐墩果烷型皂苷和达玛烷型皂苷的限速酶,对药用植物三萜皂苷的生物合成具有重要的调控作用.基于珠子参转录组数据中βAS转录本序列设计引物,利用RT-PCR方法从珠子参根状茎中克隆得到βAS基因全长cDNA序列,命名为pjβAS.经测序鉴定该基因长度为2 655 bp,包含一个2 286 bp的完整开放阅读框,编码761个氨基酸,在GenBank数据库的登录号为KX254566.生物信息学分析显示,其编码蛋白分子量为87.90 kD,理论等电点(pI) 5.84,不合跨膜区,为非分泌蛋白,含有38处磷酸化位点,主要于叶绿体和内质网中发挥生理作用;二级结构预测发现其α-螺旋占39.82％、延伸链16.56％、β-转角10.38％、无规则卷曲33.24％,具有DCTAE、QW(QXXXXXW)和MWCRCY3个氧化鲨烯环化酶(OCS)基因家族特征保守基序;pjβAS蛋白与竹节参(AKN23431.1)序列的一致性为100％,系统进化分析中与竹节参(AKN23431.1)、西洋参(AGG09939.1)、柴胡(ABY90140.2)划为同一分支.通过实时荧光定量PCR分析pjβAS在珠子参不同组织中的相对表达量,发现pjβAS基因在花、叶、茎、根状茎中均有表达,在叶中表达量最高,根状茎中表达量最低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈平	武汉轻工大学生物与制药工程学院	24	122	7.0	10.0
2	吴亚运	武汉轻工大学生物与制药工程学院	4	14	2.0	3.0
3	赵小龙	武汉轻工大学生物与制药工程学院	9	51	4.0	7.0
4	张绍鹏	武汉轻工大学生物与制药工程学院	16	23	2.0	4.0