引起甘肃省一起病毒性脑炎疫情的ECHO30全基因组序列分析

• 作者: 于德山 张勇 李煜山 武海卓 陈建华
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 病毒性脑炎 ECHO30 全基因组序列分析 重组
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 短篇论著
• 页码范围: 617-623
• 页数: 7页
• 分类号: R373.3
• 语种: 中文

摘要

为了解引起2015年甘肃省酒泉市瓜州县病毒性脑炎疫情的ECHO30的基因特点,分析其重组变异和进化规律,对从患者脑脊液标本中分离到的3株ECHO30进行全基因序列测定和分析,采用Simplot3.5.1软件进行重组分析,并利用MEGA6.0软件构建系统进化树.结果表明,本次疫情中分离到的ECHO30与E30/SD/2010/CHN株的相似度最高(92％～99％).重组分析表明甘肃ECHO30株在非结构蛋白区P2区和P3区出现了多处重组现象.由于对当地流行的肠道病毒谱不清楚,虽然发现此次流行的病毒存在重组,但是对重组片段的来源尚不明确,因此需要加强对甘肃省流行肠道病毒的本底调查工作和遗传背景的研究工作.