罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的克隆与表达分析

• 作者: 孟想想 常杰 张威威 朱丽 许锋 闫佳萍
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 罗马洋甘菊 吉马烯A合成酶 基因克隆 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1851-1859
• 页数: 9页
• 分类号: R282.12
• 字数: 6093字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2017.09.024

摘要

目的 从罗马洋甘菊Chamaemelum nobile中克隆萜类化合物合成关键酶吉马烯A合成酶(germacrene A synthase, GAS) cDNA全长,并对其进行生物信息学和组织表达分析.方法 基于前期对罗马洋甘菊转录组测序结果,设计特异性引物,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增得到GAS的cDNA全长,利用生物信息学手段对其核苷酸和编码的氨基酸序列进行分析,并预测其编码的蛋白质的理化性质和功能.通过实时定量PCR技术(qRT-PCR)检测罗马洋甘菊GAS基因(CnGAS)在罗马洋甘菊不同组织的表达水平.结果 扩增得到的罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的cDNA全长为1 785 bp,命名为CnGAS(GenBank登录号为KU589283),包含1个1 683 bp的开放阅读框(ORF),编码561个氨基酸,预测的相对分子质量和等电点分别为6 470和5.21.CnGAS基因编码的氨基酸序列与其他植物的GAS蛋白高度同源,且含有DDxxD保守序列.系统进化树表明CnGAS基因与菊科植物的GAS基因的亲缘关系最近.qRT-PCR结果显示CnGAS基因在罗马洋甘菊各组织中均有表达,且花中表达量最高.结论 从罗马洋甘菊中克隆得到CnGAS基因,分析了该基因在不同组织中的表达水平,为罗马洋甘菊萜类化合物的生物合成代谢途径的研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许锋	长江大学园艺园林学院	65	587	14.0	20.0
2	张威威	长江大学园艺园林学院	19	87	4.0	8.0
3	朱丽	长江大学园艺园林学院	6	8	2.0	2.0
4	孟想想	长江大学园艺园林学院	4	8	2.0	2.0
5	闫佳萍	长江大学园艺园林学院	2	2	1.0	1.0
6	常杰		3	6	1.0	2.0