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摘要:
2016年,本实验室共检测到3株基因1型(欧洲型)猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),分别命名为ZD1株、WK14株和WG9株,本研究对3株PRRSV进行了全基因组序列分析.遗传演化分析显示,3株PRRSV均属于基因1型Ⅰ亚型,与基因1型代表株LV的核苷酸同源性为88.7 %~88.9%,与基因2型代表株VR2332的核苷酸同源性为60.7%~60.8%.ORF3与ORF4推导氨基酸序列比对结果显示,ZD1株的ORF3提前26个氨基酸(aa)终止,这是首次报道基因1型PRRSV编码的结构蛋白存在提前终止现象,WK14株与WG9株在ORF3的245位存在1个氨基酸的缺失;3株PRRSV在ORF4的66位皆存在1个氨基酸的缺失.Simplot生物学重组软件分析表明,WK14株为重组病毒,供体病毒株为BJEU06-1,提供重组片段的病毒株为NVDC-FJ,重组位置位于第931~3 379位碱基处.ZD1株和WG9株未发现重组现象.本研究发现我国欧洲型PRRSV基因组在缺失、重组等方面正发生一些新的变化,有必要对该类病毒进行持续监测和深入研究.
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文献信息
篇名 2016年我国3株欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其全基因组特征分析
来源期刊 中国预防兽医学报 学科 农学
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 基因1型 缺失 重组
年,卷(期) 2017,(7) 所属期刊栏目 病原生物学
研究方向 页码范围 513-517
页数 5页 分类号 S852.65
字数 2501字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1008-0425.2017.07.01
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研究主题发展历程
节点文献
猪繁殖与呼吸综合征病毒
基因1型
缺失
重组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国预防兽医学报
月刊
1008-0589
23-1417/S
大16开
哈尔滨市南岗区马端街427号
14-70
1979
chi
出版文献量(篇)
4599
总下载数(次)
3
总被引数(次)
39369
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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