棉花HKT基因家族的全基因组分析

• 作者: 张香桂 徐珍珍 徐鹏 沈新莲 郭琪 黄芳
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: HKT基因家族 生物信息 棉花
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生理生化
• 页码范围: 975-981
• 页数: 7页
• 分类号: S562
• 字数: 4732字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2017.05.003

摘要

HKT(high-affinity K+transporter)转运蛋白在调节植物体内K+/Na+转运,参与逆境胁迫调控中发挥重要作用.本研究利用生物信息学方法,系统分析了棉花HKT基因家族的分类、系统进化树、组织表达以及HKT蛋白的亚细胞定位、跨膜结构、基序情况等.结果显示,棉花中共有8个HKT基因家族成员,编码的8个HKT蛋白都定位到了质膜上,具有7~10个不等的跨膜数;系统进化树分析结果表明,棉花8个HKT基因家族成员大致分为2个小组,在进化树上分支比较近的HKT基因家族成员编码的HKT蛋白具有完全相同或者比较类似的motif类型和跨膜数;组织表达分析发现,克劳茨基棉仅有GrHKT1;1和GrHKT1;22个成员在200 mmol/L的NaCl溶液处理0 h、3 h、12 h、72 h和144 h后具有不同程度的响应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄芳	南通大学生命科学院	12	13	1.0	2.0