牦牛TMEM-18基因多态性及其与生产性能关联分析

• 作者: 张全伟 张勇 张欢 王琪 赵兴绪 马友记
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牦牛 TMEM-18基因 SNP HRM 生产性状
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 89-96
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.02.013

摘要

跨膜蛋白18基因(TMEM-18)是一个末端为低聚嘧啶的基因,与动物生长发育密切相关.为了研究牦牛TMEM-18基因多态性与生产性能的关系.以192头天祝雌性牦牛血样NDA构建混合池,扩增TMEM-18基因内含子1和外显子5的序列.运用BLAST和Chromas软件分析突变位点,运用高分辨率熔解曲线分析技术(HRM)统计基因型分型,采用SHEsis软件进行基因型频率和等位基因频率计算,同时对多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,运用SPSS21.0分析基因多态位点与生产性能关联.结果表明,牦牛TMEM-18基因内含子1处存在2个多态位点,分别是861(A/G)和1267 (C/T),外显子5处存在1个多态位点为4 447(C/T).关联分析表明,牦牛TMEM-18基因861 (A/G)位点的不同基因型与牦牛的体高、体重、胴体重和屠宰率差异性显著(P＜0.05);1267(C/T)位点的不同基因型与牦牛的体高、体重和屠宰率差异性显著(P＜0.05),而牦牛TME M-18基因4447(C/T)位点的不同基因型与牦牛的体斜长、管围、胸围、体重、胴体重、净肉重、净肉率和屠宰率均存在显著性差异(P＜0.05).通过单倍型分析发现群体中存在3种单倍型组合,即ACC单倍型、GTC单倍型和GTr单倍型,其中ACC单倍型组合个体数目明显多于其他单倍型组合,为优势单倍型.本实验揭示TMEM-18基因可作为牦牛生产性能开发的候选分子标记,为牦牛遗传资源的利用、开发与新品种的选育提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵兴绪	甘肃农业大学动物医学院	178	766	13.0	19.0
5	张勇	甘肃农业大学动物医学院	147	410	9.0	11.0
6	马友记	甘肃农业大学动物科技学院	83	410	11.0	17.0
7	张欢	甘肃农业大学动物医学院	6	5	1.0	1.0
8	王琪	甘肃农业大学动物医学院	12	24	3.0	4.0
9	张全伟	甘肃农业大学生命科学技术学院	26	49	4.0	6.0