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基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞HT29的作用机制
基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞HT29的作用机制
作者:
刘鹭
吕加平
张书文
王莹
芦晶
许嫚
逄晓阳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
差异蛋白质组学
紫色杆菌素
HT29
iTRAQ同位素相对标记和绝对定量
透射电镜
摘要:
[目的]对紫色杆菌素作用后的结肠癌细胞HT29进行差异蛋白质组学分析,探究其影响的代谢通路,揭示其抑制癌细胞生长的作用机制,为新型抗癌药物的开发提供一定的参考.[方法]以不同剂量的紫色杆菌素处理HT2924、48、72 h,通过MTT试验以及透射电镜分析其对结肠癌细胞的有效抑制剂量及抑制情况.在此基础上,对提取的3个处理组的蛋白进行同位素标记,利用反相液相色谱(RP-LC)联用串联质谱(AB SCIEX Triple TOF 5600)获得样品中的多肽及其相对丰度信息,通过数据库(NCBI.Human.protein database)搜索比对,鉴定差异表达蛋白.利用GO分析、KEGG信号通路分析,解析紫色杆菌素抑癌作用代谢途径.[结果]紫色杆菌素对HT29的抑制作用呈一定的时间、剂量依赖性.当紫色杆菌素对HT29的抑制率达50%时,仅为阳性药物5-Fu剂量的1/6,具有更明显的抑制效果.电镜下观察显示,随着紫色杆菌素剂量增大,细胞内部线粒体出现空泡结构,质膜出泡;当浓度达30 mg·L-1时,细胞膜消失,染色质边集.通过差异蛋白质组学分析,共鉴定出4258个蛋白,表达差异在2倍以上的蛋白共为757个.其中高剂量组处理差异蛋白数为492个,低剂量组处理的差异蛋白数为112个,阳性对照组差异蛋白数为336个.KEGG分析显示这些差异蛋白共参与50条信号通路.其中有10条信号通路具有显著性(P<0.05),主要参与核糖体循环途径、三羧酸循环途径和RNA降解途径等.[结论]紫色杆菌素主要通过影响HT29细胞生命活动中的蛋白转录和翻译水平进而发挥抑制作用.
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文献信息
篇名
基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞HT29的作用机制
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
差异蛋白质组学
紫色杆菌素
HT29
iTRAQ同位素相对标记和绝对定量
透射电镜
年,卷(期)
2017,(9)
所属期刊栏目
食品科学与工程
研究方向
页码范围
1694-1704
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2017.09.015
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
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12
总被引数(次)
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