绿色棉纤维发育过程中DNA表观遗传变化的甲基化敏感扩增多态性分析

• 作者: 林毅 洪亮 蔡永萍 钱森和 魏明
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绿色棉 纤维发育 表观遗传 甲基化敏感扩增多态性分析
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 316-326
• 页数: 11页
• 分类号: S562.03
• 字数: 6880字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/1002-7807.qshqsh.20170405

摘要

[目的]分析绿色棉纤维发育过程中DNA甲基化状态差异.[方法]利用2组限制性内切酶EcoR Ⅰ/HpaⅡ和EcoR Ⅰ/MspⅠ对绿絮棉1号纤维基因组甲基化位点进行识别和切割,并采用甲基化敏感扩增多态性引物对切割产物进行扩增,分析基因组内5'-CCGG-3'位点的甲基化状态;同时对扩增的差异片段进行测序,分析其生物学功能.[结果]66对甲基化敏感扩增多态性引物共扩增出4112个条带;平均每个样品共扩增出822.4个带型,平均每对引物扩增出12.46个片段.随着绿色棉纤维的发育,甲基化条带总数、甲基化条带比率、全甲基化条带百分比均逐渐升高;其中,开花后10、15、20和25 d时甲基化条带总数分别比开花后5d时增加11.45％,13.86％,20.10％和33.13％.与开花后5d相比,开花后10、15、20和25 d时纤维DNA发生甲基化变化位点的比例分别为3.15％,3.43％,3.65％和2.52％;而去甲基化位点的比例分别为12.87％,14.72％,13.31％和48.81％.通过测序和Blast分析表明,17个片段与已知的功能基因同源性较高,包括棉花线粒体基因组、丝氨酸蛋白酶基因和酯酶基因,且这些基因均在开花后25 d发生去甲基化.[结论]绿色棉纤维发育过程中DNA发生了甲基化与去甲基化现象.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永萍	安徽农业大学生命科学学院	167	2775	29.0	45.0
2	林毅	安徽农业大学生命科学学院	139	2078	27.0	38.0
3	魏明	安徽工程大学生化学院	43	183	9.0	11.0
4	钱森和	安徽工程大学生化学院	7	53	5.0	7.0
8	洪亮	安徽农业大学生命科学学院	2	3	1.0	1.0