半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病相关微卫星标记筛选及QTL定位

• 作者: 位战飞 刘洋 戴欢 李祥孔 王文文 陈松林 高峰涛 高进
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 半滑舌鳎 哈维氏弧菌 微卫星标记SSR 混合分离子分析法BSA 数量性状基因座QTL
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-30
• 页数: 9页
• 分类号: S917
• 字数: 5837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2017.16071

摘要

为了筛选出与抗哈维氏弧菌病相关的微卫星标记并进行QTL定位,以2014年感染实验中存活率为52.22％的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)家系F1412(Family+年份+家系号)为材料,采用混合分离子分析法(bulked seg-regant analysis,BSA)对169个微卫星标记(SSR)进行筛选,得到1个可能与哈维氏弧菌病相关的微卫星标记scaffold479_23523.用scaffold479_23523所在的连锁群LG18上的37个SSR对94尾抗病、感病个体进行基因分型,得到3个图谱:整合图谱(LG18)、雌性图谱(LG18F)和雄性图谱(LG18M),并用两种不同的模式进行单标记分析和QTL定位.模式一得到3个显著性相关标记(P＜0.05)和1个极显著性相关标记(P＜0.01),图谱LG18F定位出一个区间qE-F1;模式二得到4个显著相关标记(P＜0.05)和1个极显著相关标记(P＜0.01),图谱LG 18M定位出两个区间qE-M1、qE-M2.在全基因组序列的分布范围上,区间qE-F1包含了qE-M1及qE-M2,因此qE-F1更可能与抗病性状相关.本研究开发出了抗哈维氏弧菌病性状相关微卫星标记及QTL区间,为抗病新品种的培育奠定了基础.