南方型紫花苜蓿耐盐突变体叶片盐胁迫应答差异基因鉴定与分析

• 作者: 张婧蕾 李佳赟 王依纯 裴翠明 马进
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 南方型紫花苜蓿 叶片 盐胁迫 转录组
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1588-1599
• 页数: 12页
• 分类号: S722.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.10.004

摘要

紫花苜蓿(Medicago sativa)是世界上被广泛种植的一种优质牧草.盐胁迫对紫花苜蓿的生长和产量具有明显抑制作用.为了理解南方型紫花苜蓿(M.sativa'Millennium’)受盐胁迫的内在分子机制,挖掘其与耐盐密切相关的功能基因.以250 mmol/L NaCl处理72 h的南方型紫花苜蓿耐盐突变体叶片进行Illumina HiSeqTM 2000高通量转录组测序,并对所获得的差异表达基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG) pathway生物信息学分析,获得可能耐盐潜在靶标基因.同时,挑选8个差异表达基因验证测序结果的可靠性.结果表明,过滤后对照(control,CK)和盐处理(salt stress,ST)样本分别保留了60 395 324和60 303 692对reads,其中54.18％和53.77％的reads能精确比对到参考序列蒺藜苜蓿(M.truncatula)上.差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)结果显示,在样品中共检测到30 900个基因表达发生改变,其中4 187上调表达,3 507下调表达.GO功能分析显示,差异表达基因主要表现在结合、催化活性、细胞组分和细胞等.KEGG Pathway分析显示,差异表达基因广泛涉及次生代谢、代谢途径及苯丙素的生物合成.另外,筛选了与紫花苜蓿盐胁迫应答相关的基因谷胱甘肽硫转移酶、超氧化物歧化酶Cu/Zn蛋白、L-抗坏血酸过氧化物酶、类受体蛋白激酶、诱导类受体蛋白激酶、蔗糖非发酵型蛋白激酶、类钙调素蛋白、胆碱单加氧酶、1-吡咯啉-5-羧酸合成酶、蛋白磷酸酶2C、海藻糖磷酸酯酶等和AP2类乙烯响应的转录因子、bHLH36转录因子、NAIl转录因子、bZIP转录因子、C3H锌指蛋白、核酸结合转录因子活性、Myb转录因子、NAC转录因子蛋白、序列特异性DNA结合转录因子蛋白和WRKY转录因子等.本研究为揭示紫花苜蓿耐盐分子机制提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马进	浙江农林大学风景园林与建筑学院	29	162	8.0	11.0
2	裴翠明	浙江农林大学风景园林与建筑学院	9	54	5.0	7.0
3	王依纯	浙江农林大学风景园林与建筑学院	3	9	2.0	3.0
4	李佳赟	浙江农林大学风景园林与建筑学院	3	9	2.0	3.0
5	张婧蕾	浙江农林大学风景园林与建筑学院	2	29	2.0	2.0