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应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析脱氧雪腐镰刀菌烯醇对小鼠肠道菌群的影响
应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析脱氧雪腐镰刀菌烯醇对小鼠肠道菌群的影响
作者:
杨俊花
赵志辉
郭文博
郭晋丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
高通量测序
脱氧雪腐镰刀菌烯醇
肠道微生物
摘要:
本试验旨在研究脱氧雪腐镰刀菌烯醇( DON)对小鼠肠道微生物多样性、物种丰度的影响。选用平均体重为20 g的BALB/c小鼠40只,随机分成对照组(灌胃灭菌生理盐水)和DON组(灌胃1.8 mg/kg BW DON),每组20个重复,每个重复1只小鼠,连续灌服28 d。试验结束后,收集新鲜粪便,每组随机选取3份,用Illumina?MiSeq高通量测序技术分析微生物群落结构和组成的变化。结果表明,1)与对照组相比,DON组测序数量减少( P>0.05)。2) DON组降低了Alpha、Beta多样性,Shannon指数较对照组显著降低( P<0.05)。3)在门水平,与对照组相比, DON组显著降低了拟杆菌门( Bacteroidetes )和脱铁杆菌门( Deferribacteres )的物种丰度( P<0.05),显著提高了变形菌门(Proteobacteria)的物种丰度(P<0.05)。在属水平,与对照组相比, DON组显著降低了副类杆菌属( Parabacteroides)、理研菌属( Rikenella)、Algoriphagus、Mucispi?rillum、嗜甲基菌属(Methylophilus)、Francisella的物种丰度(P<0.05),显著提高了梭菌属(Clos?tridium)、Robinsoniella、Allobaculum、Akkermansia的物种丰度( P<0.05)。4)聚类分析显示,DON组与对照组的肠道微生物相似性降低。由此可见,DON能显著影响小鼠肠道微生物菌群多样性及物种丰度,提示DON致肠道损伤与这些肠道菌群的变化密切相关。
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Illumina测序
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内容分析
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文献信息
篇名
应用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析脱氧雪腐镰刀菌烯醇对小鼠肠道菌群的影响
来源期刊
动物营养学报
学科
农学
关键词
高通量测序
脱氧雪腐镰刀菌烯醇
肠道微生物
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
分子营养
研究方向
页码范围
158-167
页数
10页
分类号
S811.6
字数
6584字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1006-267x.2017.01.018
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
赵志辉
上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所
51
435
10.0
19.0
2
杨俊花
上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所
19
90
5.0
9.0
3
郭文博
上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所
8
31
3.0
5.0
4
郭晋丽
上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所
3
2
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2017(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
高通量测序
脱氧雪腐镰刀菌烯醇
肠道微生物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
动物营养学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1006-267X
CN:
11-5461/S
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区圆明园西路2号中国农业大学西区动科动医大楼153室
邮发代号:
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
6257
总下载数(次)
25
总被引数(次)
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