授粉后红球姜雌性生殖器官qRT-PCR的内参基因筛选

• 作者: 孙姝兰 林浩川 钟春梅
• 来源期刊: 华南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 红球姜 内参基因 qRT-PCR GeNorm NormFinder BestKeeper
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 生物学与生物工程
• 页码范围: 67-73
• 页数: 7页
• 分类号: Q786
• 字数: 4681字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6054/j.jscnun.2017058

摘要

根据授粉后不同时间点的红球姜转录组数据库以及相关文献报道的传统内参基因,筛选出10个表达相对稳定的基因Actin-2 (ACT2)、Actin-7(ACT7)、Beta tubulin-1(TUB1)、Beta tubulin-5(TUB5)、Alpha tubulin-3(TUA3)、Ubiquitin(UBQ)、Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(GAPDH)、Elongation factor 1-alpha(EF-1α)、Cyclophilin(CYP)、Histone(H2A)作为候选内参基因,采用qRT-PCR技术,结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件对候选内参基因的表达稳定性进行分析.结果表明,在红球姜雌性生殖器官授粉后的发育过程中,GAPDH和UBQ的表达稳定性最好,均适合作为内参基因,同时使用2种作为内参基因能使实时荧光定量PCR标准化分析结果更精确.因此,最终选择GAPDH和UBQ作为实时荧光定量PCR标准化分析红球姜雌性生殖器官相关基因表达的内参基因.该研究将为探究红球姜败育的分子机理奠定基础,也为近源姜属植物内参基因的筛选提供线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙姝兰	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育与生物工程重点实验室	6	17	3.0	4.0
2	钟春梅	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育与生物工程重点实验室	3	9	1.0	3.0
3	林浩川	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育与生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0