转录组解析白三叶根际溶磷菌株RW8的解磷机制

• 作者: 曾庆飞 李小冬 王小利 舒健虹 蔡一鸣 蔡璐 陈锡
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 溶磷菌 白三叶 转录组 RW8 有机酸
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 168-179
• 页数: 12页
• 字数: 7608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2016399

摘要

采用转录组测序的方法分析了白三叶根际溶磷菌RW8在含有难溶磷(A组)、可溶磷(B组)与无磷(C组)培养条件下差异基因表达.以可溶磷为对照,在难溶磷条件下,分别检测到4782个基因在RW8中上调表达,447个基因下调表达;在无磷组中,共检测到3630个基因上调表达,209个基因下调表达.GO基因注释发现RW8在A组和C组中的差异基因聚类基本相同.生物学过程主要聚类在代谢过程、细胞过程、单细胞过程、刺激应答、定位以及生物反应调节;细胞组分主要聚类在细胞组分、细胞膜、膜组分与高分子配合体等;分子功能主要聚类在催化活性、结合功能与转运功能.代谢途径分析发现2-α-氧代羧、α-亚麻酸、五碳二元酸、脂肪酸、甘氨酸-丝氨酸-蛋氨酸以及缬氨酸-亮氨酸-异亮氨酸等代谢途径的基因显著被富集.挑选10个差异基因并用荧光定量检测其在A、B、C3种不同培养条件下的基因表达,发现所有挑选基因的表达变化与转录组结果变化趋势相同.液相色谱检测有机酸组成及含量,发现在A组和C组中乳酸、琥珀酸与柠檬酸显著高于B组,富马酸与苹果酸的含量在C组中显著升高,A组与B组差异不显著;a-酮戊二酸的含量在A组中显著增高,B组和C组差异不显著.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾庆飞	贵州省农业科学院草业研究所	12	37	4.0	6.0
2	陈锡	贵州省农业科学院草业研究所	3	14	2.0	3.0
3	王小利	贵州省农业科学院草业研究所	12	24	4.0	4.0
4	李小冬	贵州省农业科学院草业研究所	9	13	2.0	3.0
5	蔡一鸣	贵州省农业科学院草业研究所	5	16	3.0	4.0
6	蔡璐	贵州省农业科学院草业研究所	2	10	2.0	2.0
7	舒健虹	贵州省农业科学院草业研究所	7	15	3.0	3.0