基于线粒体控制区序列的光裸方格星虫群体遗传多样性分析

• 作者: 刘旭佳 周于娜 彭银辉 潘英 蔡小辉 黄国强
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 光裸方格星虫 遗传结构 线粒体控制区 北部湾
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 页码范围: 1542-1551
• 页数: 10页
• 分类号: Q347|S917.4
• 字数: 5309字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160410337

摘要

为了解光裸方格星虫的群体遗传结构和种质资源状况,对北部湾海域光裸方格星虫6个地理野生群体(广西北海、湛江、钦州、防城港、海南儋州,以及越南海防)共93个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区序列进行分析.共检测到107个变异位点,定义了85个单倍型,序列对AT有明显的偏倚性,群体总的单倍体多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.998和0.01889.单倍型邻接聚类树分析6个群体无明显分支,各单倍型分布于单倍型网络中介图中亦没有明显的地理分支.各群体间的遗传分化系数Fst值为-0.01813~0.02805,遗传分化极不明显,AMOVA分析显示光裸方格星虫的遗传差异主要来自群体内(99.74%).中性检验Tajima's D和Fu's Fs值均为负值,核苷酸不配对分布图呈明显的单峰形,提示光裸方格星虫群体在历史上曾出现群体扩张,推算出扩张时间为距今171万年前.目前光裸方格星虫仍具有较高的遗传多样性,6个地理群体间无明显遗传分化,存在频繁的基因交流,推测种群在早更新世曾出现群体扩张.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭银辉	广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室	29	121	6.0	9.0
2	潘英	广西大学动物科学技术学院	38	361	11.0	17.0
3	刘旭佳	广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室	22	117	6.0	9.0
4	黄国强	广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室	36	201	9.0	11.0
8	周于娜	广西大学动物科学技术学院	4	5	1.0	2.0
9	蔡小辉	钦州学院海洋学院海洋生命科学与技术研究中心	1	3	1.0	1.0