普通烟草ERF转录因子亚家族成员鉴定及表达模式分析

• 作者: 任昂彦 孔英珍
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 普通烟草 ERF基因家族 生物信息 表达模式 基因家族
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 15-22
• 页数: 8页
• 分类号: S572.03
• 语种: 中文
• DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2017.01.003

摘要

乙烯结合响应因子(Ethylene-responsive element binding factors,ERF)家族广泛参与植物的生长发育、逆境调节及激素信号应答等过程.利用生物信息方法,鉴定普通烟草基因组ERF转录因子亚家族成员,并对该亚家族成员的染色体定位、理化性质、系统发生、保守结构域、亚细胞定位和组织表达模式进行分析.结果显示,目前在普通烟草中得到121个ERF基因,在烟草24条染色体分布位置具有不均匀性.通过构建进化树,根据拟南芥ERF亚家族的分类方式将烟草ERF亚家族分为6组,同一分组成员的理化性质及保守域呈现高度一致性.亚细胞定位分析结果显示,绝大部分成员定位在细胞核,少数定位在线粒体和叶绿体上.组织表达模式分析结果显示,烟草ERF基因在幼根、成熟根、离体叶和茎中表达量较高,不同分组成员之间表达存在差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任昂彦	中国农业科学院烟草研究所	2	5	1.0	2.0
5	孔英珍	中国农业科学院烟草研究所	6	21	3.0	4.0