华山新麦草Ns基因组特异序列的克隆及分子标记的建立

• 作者: 宣朴 张洁 李耀华 王颖 蒋云 郭元林
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 华山新麦草 随机扩增多态性DNA (RAPD) 反转录转座子 分子标记
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1391-1399
• 页数: 9页
• 分类号: S188
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.09.002

摘要

华山新麦草(Psathyrostachys huashanica)是我国特有的物种,表现出多种抗病以及抗逆性状.为建立华山新麦草Ns基因组特异的分子标记,本研究利用204余条随机引物对华山新麦草、普通小麦的基因组DNA进行随机扩增多态性DNA (random amplified polymorphic DNA,RAPD)标记分析,其中随机引物OP-D15和OP-F19能在华山新麦草的基因组DNA中稳定扩增出特异的DNA片段,长度分别为1 106和1 344 bp,分别命名为Psh-D15和Psh-F 19.经序列比对分析发现,Psh-D15和Psh-F19分别属于Gypsy类型和Copia类型的反转录转座子序列.随后根据其与小麦中同源序列的比对结果,在二者低同源区设计了两对特定序列扩增(sequence characterized amplified regions,SCAR)引物Psh-D 15 F/R和Psh-F 19 F/R,并利用其同时对华山新麦草、山羊草属(Aegilops)、簇毛麦属(Dasypyrum)、赖草属(Leymus)、偃麦草属(Elytrigia)、冰草属(Agropyron)、大麦属(Hordeum)、黑麦(Secale)、乌拉尔图小麦(Triticum urartu),硬粒小麦(Triticum durum),以及普通小麦(Triticum aestivum)的基因组DNA进行PCR扩增,以检验其有效性和特异性.结果表明,两对引物均只在华山新麦草的基因组DNA中扩增出了目标条带,表明这两个SCAR标记是华山新麦草的Ns基因组所特有的,分别命名为Psh-D15270和Psh-F19558.新的Ns基因组特异SCAR标记Psh-D15270和Psh-F1 9.8的开发为小麦-华山新麦草杂种材料的分子鉴定提供了新的有力工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋云	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	14	29	3.0	4.0
2	宣朴	四川省农业科学院农产品加工研究所	27	234	9.0	15.0
3	郭元林	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	18	92	5.0	9.0
4	张洁	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	12	28	3.0	4.0
8	李耀华	西南大学生物技术中心	1	3	1.0	1.0
9	王颖	四川省农业科学院生物技术核技术研究所	4	4	1.0	2.0