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摘要:
非核糖体肽(NRP)是具有化学结构和生物活性多样性的一类重要的天然产物,其肽骨架的生物合成是由非核糖体肽合成酶(NRPS)催化完成.所有的NRPS含有三个最基本的催化功能域:腺苷化功能域(A domain),肽载体蛋白功能域(PCP)和缩合功能域(C domain).在菌株优选和天然产物的探索发现中,基于天然产物生物合成中重要蛋白质的保守氨基酸序列设计简并引物而进行的PCR筛选已经成为一种十分有效的方法.在本研究中,基于NRPS中腺苷化功能域的保守序列设计简并引物,用PCR的方法从100株土壤放线菌中筛选得到了21株“阳性”菌株.在对21株“阳性”菌株的小规模发酵粗提物的HPLC分析基础上,选择了其中一株链霉菌HMU0027进行大规模发酵培养,通过色谱分离和谱学技术鉴定得到了七个NRPS产生的thiazostatin类嗜铁素(siderophore)类似物(1-7).其中化合物1是一个新化合物,其含有罕见的苯酚类嗜铁素与糖基团连接的结构特色.本研究为进一步对这些thiazostatin类似物的生物合成研究打下了坚实基础,并展示了基于生物合成知识的基因组挖掘技术在非核糖体肽类天然产物探索发现中的巨大潜力.
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文献信息
篇名 利用靶向非核糖体肽合成酶的PCR技术从链霉菌HMU0027中发现thiazostatin类嗜铁素
来源期刊 中国药学(英文版) 学科 医学
关键词 基因组挖掘 非核糖体肽合成酶 嗜铁素 菌株优选 Thiazostatin
年,卷(期) 2017,(10) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 737-746
页数 10页 分类号 R284
字数 语种 英文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 金晶 12 37 4.0 5.0
2 张英涛 17 154 6.0 12.0
3 马明 10 21 2.0 4.0
4 杨东辉 14 71 3.0 8.0
5 杨小燕 3 0 0.0 0.0
6 周梦洁 2 0 0.0 0.0
7 刘发旺 2 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
基因组挖掘
非核糖体肽合成酶
嗜铁素
菌株优选
Thiazostatin
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国药学(英文版)
月刊
1003-1057
11-2863/R
大16开
北京海淀区学院路38号
1992
eng
出版文献量(篇)
1601
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1
总被引数(次)
6895
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