基于SSR分子标记的大蒜种质资源遗传多样性研究

• 作者: 刘世琦 刘星辰 史庆华 孙亚丽 孙秀东 钱胜艳 陈亚霏
• 来源期刊: 山东农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 大蒜 SSR 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 384-389
• 页数: 6页
• 分类号: S633.4
• 字数: 3698字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2324.2017.03.013

摘要

大蒜为无性繁殖作物,其生物学特征在经历气候变迁、自然选择和人工选择后发生了多方面变异,从而形成了众多地方品种.因此,研究大蒜种质资源的遗传多样性为大蒜的科学分类及品种鉴定、保存、遗传改良提供科学依据.采用SSR(简单重复序列,simple sequence repeats)分子标记技术对55份大蒜种质的基因组DNA进行多态性扩增.用POPGENE version1.32软件计算有效等位基因数Ne、Nei's遗传相似系数(GS)、遗传距离(GD)、Nei's遗传多样性指数、Shannon信息指数等指标,并采用NTSYS pc 21-2软件进行种质间的UPGMA(非加权组平均法,un-weighted pair-group method)聚类分析和基于Nei's遗传距离的组群间聚类分析.结果表明,7对引物共扩增出75条带,多态性条带为73条(多态性比率为97.33%),每对引物平均扩增出10.71个位点和10.43个多态性位点,说明SSR分子标记揭示的多态性强.55份大蒜种质的平均Nei's遗传多样性指数和平均Shannon信息指数分别为0.1335和0.2278.大蒜具有较高的遗传多样性,聚为一类的大蒜多来源于相同或相近区域.