大丽轮枝菌侵染陆地棉早期的转录组分析

• 作者: 周玉梅 左开井 张志东 李建福 段兴鹏 赵佳薇 韩松 高正银
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大丽轮枝菌 转录组分析 细胞增殖 致病机理
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 253-260
• 页数: 8页
• 分类号: S562.035
• 字数: 5058字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/1002-7807.zzdzkj.20170508

摘要

[目的]旨在深入挖掘大丽轮枝菌致病相关基因.[方法]运用转录组测序技术比较分析了强致病力大丽轮枝菌Vd991在侵染陆地棉品种Coker 312早期阶段的基因表达情况.[结果]对Vd991侵染前后的转录组数据进行差异表达分析,共筛选到979个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中376个上调,603个下调.通过基因注释和功能分类发现,这些DEGs涉及细胞增殖与生长、产孢、碳水化合物结合、蛋白激酶活性调节、裂解酶活性、水解酶活性等功能.对上调DEGs进行基因本体(Gene ontology,GO)功能富集分析,发现共有277个GO词条达到显著富集水平(P＜0.05),涉及生长速率正向调控、核苷酸合成、解旋酶活性等功能;京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析表明,上调DEGs参与53个代谢通路,包括嘧啶代谢、嘌呤代谢等.[结论]在早期侵染过程中,大丽轮枝菌细胞增殖相关基因表现活跃.上述分析为进一步揭示大丽轮枝菌的致病机理提供了有价值的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	左开井	上海交通大学农业与生物学院	14	131	7.0	11.0
2	韩松	上海交通大学农业与生物学院	5	13	2.0	3.0
3	李建福	上海交通大学农业与生物学院	2	2	1.0	1.0
4	张志东	上海交通大学农业与生物学院	2	2	1.0	1.0
5	段兴鹏	上海交通大学农业与生物学院	2	2	1.0	1.0
6	周玉梅	上海交通大学农业与生物学院	1	2	1.0	1.0
7	高正银	上海交通大学农业与生物学院	2	2	1.0	1.0
8	赵佳薇	上海交通大学农业与生物学院	1	2	1.0	1.0