巴西橡胶树PEPRK基因家族成员的鉴定和表达分析

• 作者: 周斌辉 唐朝荣 戚继艳 方永军 肖小虎 隋金蕾
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 巴西橡胶树 PEPRK 基因家族 结构与进化 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 70-75
• 页数: 6页
• 分类号: S794.1
• 字数: 3158字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.01.013

摘要

PEP羧化酶激酶相关激酶(PEP carboxylase kinase-related kinases,PEPRKs)是CDPK-SnRK超家族的一员,目前对其生理功能尚不清楚.本研究以拟南芥和杨树的PEPRK序列作为探针,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,共鉴定得到25个PEPRK基因家族成员,其中包括5个橡胶树PEPRK基因,命名为HbPEPRK1-5.序列分析发现橡胶树PEPRK和其他植物类似,在序列中部含有一个相对比较保守的激酶结构域,而两端的同源性相对较低.在基因结构和进化方面,PEPRK主要分为2个大的分支,相同分支的成员在结构域和内含子分布上更为相似,其中橡胶树和木薯PEPRK在进化上具有较近的亲缘关系.在基因的表达方面,HbPEPRK1主要在稳定期的叶片中表达,Hb PEPRK2和HbPEPRK5在树叶、树皮和胶乳中均有表达,HbPEPRK4主要在种子中表达;另外,研究发现橡胶树PEPRK家族成员的表达还与叶片发育、乙烯利刺激、真菌侵染和低温胁迫具有一定的相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐朝荣	中国热带农业科学院橡胶研究所	41	253	8.0	14.0
2	戚继艳	中国热带农业科学院橡胶研究所	19	93	4.0	9.0
3	肖小虎	中国热带农业科学院橡胶研究所	12	29	3.0	5.0
4	隋金蕾	中国热带农业科学院橡胶研究所	5	5	2.0	2.0
8	方永军	中国热带农业科学院橡胶研究所	14	47	5.0	6.0
9	周斌辉	中国热带农业科学院橡胶研究所	5	3	1.0	1.0