华东地区地方鸡品种mtDNA控制区遗传多样性

• 作者: 唐修君 樊艳凤 葛庆联 贾晓旭 陆俊贤 韩威 高玉时 黄胜海
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: 系统发育 红色原鸡 控制区 地方品种
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 动物多样性
• 页码范围: 540-548
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2017012

摘要

为了探明我国华东地区地方鸡品种的遗传多样性和群体遗传结构,追溯其母系起源和进化过程,利用PCR技术扩增了11个地方鸡品种的线粒体DNA (mtDNA)控制区(D-loop)序列,并结合NCBI数据库中已发表的红色原鸡(Gallus gallus) D-loop区全序列,分析了它们的遗传多样性与亲缘关系,构建了1 1个品种与红色原鸡系统发生邻接树.结果表明:11个地方品种mtDNA D-loop区全长为l,231或1,232 bp,其中1,231 bp的序列有196条,1,232 bp的序列有123条,经过比对发现,两者在859 bp处存在单碱基缺失.11个地方品种319个个体共计检测到变异位点37个,总体单倍型多样度核苷酸多样度和平均核苷酸差异分别为0.901±0.009、0.00573±0.000001和6.833.按照鸡mtDNA单倍型分类通用标准,共包含35种单倍型,可以分为A、B、C和E共4个分支(单倍型群),分别包括11、10、9和5个单倍型.中介网络图中11个鸡品种也很明显地分成了4个支系,分别含有100、118、47和54条序列.系统发育树分为4个大枝,海南亚种(G.gallus jabouillei)自成一枝;C单倍型群与4个亚种的红色原鸡聚为一枝;E单倍型群与2个亚种红色原鸡聚为一枝;A和B单倍型群只与滇南亚种(G.gallus spadiceus)聚为一枝.11个品种中,除了狼山和丝羽乌骨鸡2个标准化品种外,都有很高的遗传多样性,可开发选择潜力很大.没有发现线粒体品种特异性DNA序列.华东地区地方品种至少有4个母系起源,部分品种可能受到了欧美高产品系的渗入.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆俊贤		41	149	7.0	11.0
2	高玉时		52	315	7.0	17.0
3	黄胜海		17	42	4.0	6.0
4	韩威		15	38	4.0	5.0
5	葛庆联		29	118	6.0	9.0
6	樊艳凤		21	47	4.0	6.0
7	贾晓旭		28	82	6.0	8.0
8	唐修君		32	93	6.0	8.0