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蓝鹇源H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因序列分析
蓝鹇源H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因序列分析
作者:
单芬
彭仕明
李婉萍
焦培荣
王念晨
王文清
陈武
原文服务方:
野生动物学报
禽流感病毒
H9N2亚型
序列分析
进化树
摘要:
为了探查禽流感病毒H9N2在圈养蓝鹇中的流行规律及变异情况,从圈养蓝鹇(Lophura swinhoii分离1株H9N2亚型禽流感病毒,对其HA及NA基因进行PCR扩增并进行序列分析.本分离株的HA基因序列与Genbank中广西鸡源2014年分离株A/chicken/Guangxi/CLB02/2014 (H9N2)(KT023046)的核苷酸序列相似性最高,为99%;而NA基因与登录号为KM455874,2013人源分离株A/Lengshuitan/11197/2013(H9N2)的NA核苷酸序列相似性最高,为97%.HA蛋白序列分析显示:HA的226位氨基酸残基为亮氨酸(Leu),具有哺乳动物SAα2-6受体结合的特性,裂解位点处的基序PSRSSR ↓ GL,明显发生1个碱性氨基酸的变异.HA蛋白具有9个潜在N-糖基化位点,分别位于29、82、141、218、298、305、313、492、551位;HA受体结合位点氨基酸变异明显.NA蛋白序列分析显示:NA蛋白颈部63 ~ 65位氨基酸缺失,具有7个潜在的糖基化位点,分别位于69、86、146、200、234、264、368位;NA蛋白红细胞结合位点、抗原决定簇区域氨基酸变异活跃.HA、NA基因进化树分析显示该分离株属于欧亚分支中Y280-Like小进化分支,与疫苗株虽属于同一进化分支中,但亲缘关系较远.蓝鹇源H9N2亚型禽流感病毒(LS/GD/P29/16) HA和NA基因发生一定程度的变异,需要加强流行病学监测.
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篇名
蓝鹇源H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因序列分析
来源期刊
野生动物学报
学科
关键词
禽流感病毒
H9N2亚型
序列分析
进化树
年,卷(期)
2017,(3)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
441-446
页数
6页
分类号
S852.65|Q7
字数
语种
中文
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H9N2亚型
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期刊影响力
野生动物学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
季刊
ISSN:
1000-0127
CN:
23-1587/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1979-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
2825
总下载数(次)
0
总被引数(次)
9186
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