2008-2015年内蒙古自治区风疹病毒分子流行病学分析

• 作者: 朱贞 李小东 王文瑞 田晓灵 闫绍宏 顾苏仪
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 风疹病毒 基因型 分子流行病学 氨基酸序列 突变
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 135-140
• 页数: 6页
• 分类号: R511.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2017.02.010

摘要

目的 对2008-2015年在内蒙古地区分离的风疹病毒进行分子流行病学研究,为该地区风疹防控策略的制定提供病毒学数据.方法 使用Vero细胞、Vero/SLAM细胞对2008-2015年在内蒙古6个市/盟风疹暴发和散发病例中采集的125份咽拭子和尿液标本进行病毒分离,鉴定后使用RT-PCR方法扩增阳性风疹病毒分离株E1基因的l 107个核苷酸序列,并对该PCR产物进行序列测定和分析,并基于世界卫生组织(WHO)基因定型靶序列739个核苷酸序列构建基因亲缘关系树.结果 2008-2015年在内蒙古地区共分离获得14株风疹病毒株,分属1E-Cluster A基因型(13株,2008-2014年)和2B-Lineage 3基因型(1株,2015年).1E基因型风疹病毒于2008年首次分离到,为内蒙古地区风疹病毒流行的优势基因型,并呈现了多个不同的病毒传播链.2B基因型风疹病毒在2015年首次分离到,并与2011年安徽淮南代表株形成一个进化分支.序列分析结果显示,2008-2015年内蒙古地区流行的14株风疹病毒大部分核苷酸的突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了2015年1株代表株在E1蛋白中和抗原决定簇的257位由Leu变为Phe,其余毒株在重要功能位点均未发生变异.结论 2008-2015年内蒙古地区流行的风疹病毒是以1E (Cluster A)和2B (Lineage 3)基因型流行引起的多个传播链所致,与我国其他省份流行情况一致.本研究为内蒙古地区风疹的防控提供了一定的风疹病毒分子流行病学基线数据.