齐口裂腹鱼CDH5基因特性及其对温和气单胞菌感染的应答

• 作者: 段荟芹 王利
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: CDH5 齐口裂腹鱼 组织表达 温和气单胞菌
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 162-168
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.03.023

摘要

探讨齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)血管内皮黏附分子(Cadherin 5,CDH5)的基因特性.用生物信息学软件分析齐口裂腹鱼CDH5基因序列,用Real-time PCR检测CDH5基因在齐口裂腹鱼感染温和气单胞菌后0 h、24 h和48 h的表达变化.获得CDH5基因全长cDNA序列,GenBank登录号为KT329441.该序列长4825 bp,开放阅读框长2313 bp,编码770个氨基酸.蛋白预测结果显示,该蛋白相对分子量为85.19 kD,等电点为5.01.存在信号肽序列,二级结构以随机卷曲、延伸链、α-螺旋为主.齐口裂腹鱼CDH5氨基酸序列与斑马鱼同源性达74%,与人的相似性为43%.CDH5在感染温和气单胞菌后在各组织中均有表达.脾脏中CDH5基因在24 h表达量显著高于0 h和48 h(P<0.05).肝脏、肾脏和肌肉中CDH5在48 h的表达量均显著高于24 h(P<0.05).心脏和肠道中CDH5基因在48 h的表达量显著高于0 h(P<0.05).CDH5基因在可能参与了齐口裂腹鱼抗温和气单胞菌感染的免疫应答,为深入研究CDH5在齐口裂腹鱼中的功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王利	西南民族大学生命科学与技术学院	74	222	8.0	12.0
2	段荟芹	西南民族大学青藏高原研究院	9	20	3.0	4.0