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摘要:
目的:通过生物大数据挖掘,探讨长链非编码RNA(long noncoding RN,lncRNA)与黑色素瘤发生发展的关系.方法:从基因表达综合数据库中的黑色素瘤mRNA表达谱数据集GSE15605中提取出一些lncRNA的表达信息,并分析这些lncRNA与黑色素瘤的关联关系.结果:LINC01213,PGM5-AS1,LINC01133和LOC284578共4个lncRNA与黑色素瘤的发生和转移显著相关,其中LINC01213,LINC01133和LOC284578的表达可被BRAF基因突变影响,而PGM5-AS1的表达能被NRAS基因突变影响.利用这4个lncRNA的表达值构建的预测模型可较好地区分正常样本、初发黑色素瘤样本和转移性黑色素瘤样本.结论:LncRNA可能在黑色素瘤的发生和转移中起重要作用.
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文献信息
篇名 多种IncRNA可影响黑色素瘤的发生和发展
来源期刊 中南大学学报(医学版) 学科
关键词 黑色素瘤 长链非编码RNA 基因表达 数据提取 预测模型
年,卷(期) 2017,(2) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 134-138
页数 5页 分类号
字数 2560字 语种 中文
DOI 10.11817/j.issn.1672-7347.2017.02.003
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研究主题发展历程
节点文献
黑色素瘤
长链非编码RNA
基因表达
数据提取
预测模型
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
中南大学学报(医学版)
月刊
1672-7347
43-1427/R
大16开
湖南省长沙市湘雅路110号中南大学湘雅医学院75号信箱
42-10
1958
chi
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