白桦漆酶BpLAC1基因生物信息学分析

• 作者: 冯连荣 宋立志 池玉杰 王玉成 赵大根
• 来源期刊: 南方林业科学
• 关键词: 白桦 漆酶 LAC1基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 19-22
• 页数: 4页
• 分类号: Q75
• 语种: 中文
• DOI: 10.16259/j.cnki.36-1342/s.2017.03.005

摘要

为了深入了解白桦漆酶BpLAC1基因的功能,利用生物信息学方法对其结构域及功能进行预测,包括开放阅读框分析、信号肽预测、基本理化性质分析、糖基化位点预测、保守结构域分析、系统进化分析、蛋白质二级及三级结构预测.结果如下:BpLAC1基因序列全长为1677 bp,开放阅读框ORF长为1677 bp,编码558个氨基酸,蛋白相对分子量为58.6 kDa,理论等电点为9.53,是稳定的亲水蛋白;具有2个糖基化位点和13个磷酸化位点;该蛋白含有一个信号肽,属于分泌型蛋白;含有3个Cu-oxidase保守区,属于Cupredoxin superfamily家族;系统发育树分析表明,BpLAC1蛋白与川桑亲缘关系较近,与柑橘属Citrus、鹰嘴豆属Cicer等亲缘关系相差较远.二级结构中α-螺旋占14.04%,β-转角占11.99%,不规则卷曲链39.51%,延伸链占据34.46%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	池玉杰	东北林业大学林学院	75	791	12.0	25.0
2	王玉成	东北林业大学林学院	73	1097	18.0	31.0