普通烟草RLP类受体蛋白家族成员的鉴定与进化、表达分析

• 作者: 刘成 李奎 李晓旭 段奇佳 郭永峰
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 普通烟草 RLP基因家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 63-68
• 页数: 6页
• 分类号: S572.03
• 语种: 中文
• DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2017.02.011

摘要

类受体蛋白(receptor-like proteins,RLPs)作为一类细胞表面受体,广泛存在于高等植物中,参与调控植物生长发育和抗逆等过程.本研究以普通烟草(Nicotiana tabacum)TN90数据库为基础,构建隐马尔科夫模型进行检索,鉴定了普通烟草RLP家族成员;采用邻接法构建系统发育树进行系统进化分析;利用GSDS对RLP家族成员的基因结构进行了分析;利用普通烟草TN90转录组数据,分析RLP基因家族成员的表达情况;最后对普通烟草RLP家族成员进行GO注释分析.结果表明,在普通烟草中共鉴定出70个RLP家族成员,各成员的氨基酸序列长度和等电点差异较大;系统进化与基因结构分析表明,普通烟草RLP家族成员划分为6个亚家族,基因结构较为简单;转录组分析结果显示,RLP基因家族成员在不同组织和发育时期的表达有较大差异,个别成员在叶片衰老时期表达量较高;GO注释结果表明,RLPs在植物的生长发育、逆境响应等过程中发挥作用.本研究结果将为普通烟草RLP基因功能分析和利用奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李奎	中国农业科学院烟草研究所	73	382	11.0	16.0
5	刘成	中国农业科学院烟草研究所	15	52	3.0	7.0
7	李晓旭	中国农业科学院烟草研究所	5	9	2.0	3.0
11	郭永峰	中国农业科学院烟草研究所	5	10	2.0	3.0
14	段奇佳	中国农业科学院烟草研究所	1	0	0.0	0.0