虎皮鹦鹉全基因组中微卫星分布规律研究

• 作者: 原宝东 杨承忠 黄杰
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 虎皮鹦鹉 基因组 微卫星
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 422-426
• 页数: 5页
• 分类号: Q78|Q953
• 语种: 中文

摘要

对虎皮鹦鹉(Melopsittacus undulatus)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到1～6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1Gb)的0.41％,分布频率为82.9/Mb.不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7％;其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3％,13.7％,10.8％,2.9％,0.5％.单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAAGA最多,六碱基中AACCCT最多.A、AT、C、AC、AAT、AAAC、AAAT、AGG、AGC、AG、AAAG、AAC、ATCC、AAGG、AGAT、ATC、AACC、ACC依次是虎皮鹦鹉基因组中分布数量最多的18种微卫星重复拷贝类型.本研究将为虎皮鹦鹉微卫星标记的分离筛选、遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	原宝东	商丘师范学院生物与食品学院	17	22	3.0	3.0
2	黄杰	商丘师范学院生物与食品学院	7	8	2.0	2.0
3	杨承忠	重庆师范大学生命科学学院	23	26	3.0	4.0