解甘露醇罗尔斯顿菌金属蛋白酶基因特征分析

• 作者: 徐爱芳 潘克女 葛玉梅 郁文燕
• 来源期刊: 国际流行病学传染病学杂志
• 关键词: 金属蛋白酶类 解甘露醇罗尔斯顿菌 基因特征 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 161-166
• 页数: 6页
• 字数: 3330字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4149.2017.03.004

摘要

目的 检测解甘露醇罗尔斯顿菌临床分离株的金属蛋白酶基因,并分析其编码蛋白结构特征.方法 采用Axygen细菌基因组提取试剂盒提取解甘露醇罗尔斯顿菌临床分离株DNA,建立基于金属蛋白酶基因的PCR检测方法,使用BLAST比对基因序列,使用CDD、MEROPS、SWISS-MODEL、CDTree、TMHMM和SignalP 4.1对编码蛋白进行在线分析.结果 在该解甘露醇罗尔斯顿菌临床分离株中分别检测出M48和S2P-M50家族金属蛋白酶基因RS-MP48和RS-MP50,与已报道的解甘露醇罗尔斯顿菌SN82F48株所携带的基因序列(WP_045785189.1和WP_045786756.1)相似度为100％.生物信息学研究表明,RS-MP48含有1个M48蛋白酶超家族保守功能域和4个跨膜结构,与芽孢杆菌M48肽酶家族、芽孢杆菌锌依赖蛋白酶、铜绿假单胞菌锌依赖蛋白酶同源性最高,相似度均为99％;与链霉菌热休克蛋白和铜绿微囊藻蛋白酶相似度分别为33％和32％;RS-MP50含有2个S2P-M50超家族保守功能域和4个明显的跨膜结构及少量的膜结合区;与解甘露醇罗尔斯顿菌RIP金属蛋白酶RseP同源性最高,相似度为99％,与罗尔斯顿菌属RIP金属蛋白酶RseP和蛋白酶调节因子相似度均为92％,与脑膜炎奈瑟菌和希瓦菌RseA锌金属蛋白降解酶RseP相似度分别为39％和38％.结论 解甘露醇罗尔斯顿菌是引起人类感染的新病原菌,本研究发现该临床株中存在金属蛋白酶基因,其编码蛋白可能是该类细菌潜在的毒力因子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐爱芳	杭州市西溪医院检验科	20	23	3.0	4.0
2	葛玉梅	浙江省人民医院检验中心	7	35	3.0	5.0
3	郁文燕	杭州市西溪医院检验科	8	19	3.0	4.0
4	潘克女	杭州市西溪医院检验科	12	10	2.0	3.0