中山市2007—2014年1型登革病毒E基因分子特征分析

• 作者: 余昆英 吴衍恒 师舞阳 林金思 谢颖
• 来源期刊: 南昌大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 1型登革病毒 E基因 序列同源性 系统进化 广东,中山
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 79-83,87
• 页数: 6页
• 分类号: R373.3+3|R512.8
• 字数: 4144字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13764/j.cnki.ncdm.2017.01.021

摘要

目的 分离、鉴定中山市2007—2014年1型登革病毒并获得E基因序列,从分子水平分析其系统进化和地域来源情况,了解该病毒各年份的流行性质.方法 收集中山市2007—2014年登革热患者急性期血清,接种C6/36细胞分离登革病毒,应用RT-PCR技术扩增病毒的包膜蛋白E基因全长,并对序列进行系统进化和同源性分析.结果 共分离到登革1型病毒流行株25株,参考国际标准株E基因序列将其分为GⅠ型和GⅤ型2个基因型.其中2007年3株,2012年3株,2013年3株,2014年7株聚集在GⅠ型中,2014年9株聚集在GⅤ型中.中山2014年登革病毒GⅠ型流行株与中山市2007年、2012年、2013年流行株E基因核苷酸(氨基酸)序列相似度分别为98.25%(99.40%)、98.18%(99.80%)、99.73%(100.00%),与珠三角2014年广州、珠海输入中山株的氨基酸序列相似度为100.00%;中山市2013年登革病毒GⅠ型流行株与广州、佛山的2013年流行株E基因核苷酸(氨基酸)序列相似度分别为99.67%(100.00%)、99.74%(100.00%).结论 2007—2014年中山市流行的登革1型病毒有2个基因型(GⅠ型和GⅤ型).2014年GⅤ型可能由国外输入,GⅠ型中2007年和2012年为国外输入株,2013年及2014年流行株E基因序列相似度高,2014年的登革流行可能与2013年流行株本地化有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴衍恒	中山市疾病预防控制中心检验科	13	22	2.0	4.0
2	师舞阳	中山市疾病预防控制中心检验科	15	36	3.0	5.0
3	谢颖	中山市疾病预防控制中心检验科	9	7	2.0	2.0
4	林金思	中山市疾病预防控制中心检验科	4	4	1.0	1.0
5	余昆英	中山市疾病预防控制中心检验科	6	17	3.0	3.0